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  1. RNA modification
    Autor*in:
    Erschienen: 2007
    Verlag:  Elsevier, Amsterdam

    Standort:
    Institut für Biochemie und Molekularbiologie, Bibliothek
    Signatur:
    Frei 8: HB 100-425
    Fernleihe:
    keine Ausleihe von Bänden, nur Papierkopien werden versandt
    Link zum Verbundkatalog:
    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Heidelberg
    Signatur:
    UBN/WC 4460 G885
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Karlsruher Institut für Technologie, KIT-Bibliothek
    Signatur:
    2007 A 6863
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universität Konstanz, Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM)
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universität Leipzig, Universitätsbibliothek, Bibliothek Medizin/Naturwissenschaften
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Stuttgart
    Signatur:
    5N 4038
    Fernleihe:
    keine Ausleihe von Bänden, nur Papierkopien werden versandt
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Tübingen, Bereichsbibliothek Biologie
    Signatur:
    Z (Zeitschrift)
    Fernleihe:
    keine Ausleihe von Bänden, nur Papierkopien werden versandt
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universität Ulm, Kommunikations- und Informationszentrum, Bibliotheksservices
    Signatur:
    QU 135/1955 C-425
    Fernleihe:
    keine Ausleihe von Bänden, nur Papierkopien werden versandt
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)
    Export in Literaturverwaltung   RIS-Format
      BibTeX-Format
    Hinweise zum Inhalt
    Quelle: Verbundkataloge
    Beteiligt: Gott, Jonatha M. (Hrsg.)
    Sprache: Englisch
    Medientyp: Buch (Monographie)
    Format: Druck
    ISBN: 9780123741554; 0123741556
    Weitere Identifier:
    9780123741554
    RVK Klassifikation: WC 4355 ; WC 4460
    Schriftenreihe: Methods in enzymology ; 425
    Schlagworte: RNA editing
    Umfang: XLII, 433 S., [8] Bl., Ill., graph. Darst., 24cm
    Bemerkung(en):

    Includes bibliographical references and indexes
  2. RNA modification
    Autor*in:
    Erschienen: 2007
    Verlag:  Elsevier, Amsterdam

    The presence of modified nucleotides in cellular RNAs has been known for decades and over 100 distinct RNA modifications have been characterized to date. While the exact role of many of these modifications is still unclear, many are highly conserved... mehr

    Standort:
    Technische Universität Bergakademie Freiberg, Bibliothek 'Georgius Agricola'
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Freiburg
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt / Zentrale
    Signatur:
    ebook
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Heidelberg
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Karlsruher Institut für Technologie, KIT-Bibliothek
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

    Standort:
    Bibliotheks-und Informationssystem der Carl von Ossietzky Universität Oldenburg (BIS)
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Standort:
    Bibliotheks-und Informationssystem der Carl von Ossietzky Universität Oldenburg (BIS)
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Stuttgart
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Südwestdeutscher Bibliotheksverbund (SWB)

     

    The presence of modified nucleotides in cellular RNAs has been known for decades and over 100 distinct RNA modifications have been characterized to date. While the exact role of many of these modifications is still unclear, many are highly conserved across evolution and most contribute to the overall fitness of the organism. In recent years, new methods and bioinformatics approaches have been developed for the dissection of modification pathways and functions. These methods intersect a number of related fields, ranging from RNA processing to comparative genomics and systems biology. In addition, many of the techniques described in this volume have broad applicability, particularly in regards to the isolation, characterization, and reconstitution of ribonucleoprotein complexes, expanding the experimental repertoire available to all RNA researchers

     
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      BibTeX-Format
    Hinweise zum Inhalt
    Quelle: Verbundkataloge
    Beteiligt: Gott, Jonatha M. (Hrsg.)
    Sprache: Englisch
    Medientyp: Ebook
    Format: Online
    ISBN: 0123741556
    RVK Klassifikation: WC 4355 ; WC 4460
    Auflage/Ausgabe: Online-Ausg.
    Schriftenreihe: Methods in enzymology ; 425
    Methods in enzymology 0076-6879 ; v. 425
    Schlagworte: RNA editing
    Weitere Schlagworte: RNA Editing
    Umfang: Online-Ressource, illustrations.
    Bemerkung(en):

    Includes bibliographical references and indexes. - Print version record
  3. RNA modification
    Autor*in:
    Erschienen: 2007
    Verlag:  Elsevier, Acad. Press, Amsterdam [u.a.]

    Standort:
    Universitätsbibliothek Braunschweig
    Signatur:
    2876-1460
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Staats- und Universitätsbibliothek Bremen
    Signatur:
    h bcp 520 d/80-425
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Max-Planck-Institut für Molekulare Zellbiologie und Genetik, Bibliothek
    Signatur:
    MIE 425
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), Wissenschaftliche Bibliothek / Dokumentation
    Signatur:
    E-33(425)
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Greifswald
    Signatur:
    660/WC 4355-425
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Max-Planck-Institut für experimentelle Medizin, Karl-Thomas-Bibliothek
    Signatur:
    Magazin-Anbau
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Niedersächsische Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen
    Signatur:
    2007 A 20698
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Otto-Hahn-Bibliothek des Max-Planck-Instituts für biophysikalische Chemie
    Signatur:
    E 4/03 b
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt / Zentrale
    Signatur:
    BT Hm 20 (425)
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Staats- und Universitätsbibliothek Hamburg Carl von Ossietzky
    Signatur:
    MAGAZIN
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Technische Informationsbibliothek (TIB) / Leibniz-Informationszentrum Technik und Naturwissenschaften und Universitätsbibliothek
    Signatur:
    FA 3330(425)
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Thüringer Universitäts- und Landesbibliothek
    Signatur:
    BIO:EN:0110:MiE:425:2007
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Standort:
    Thüringer Universitäts- und Landesbibliothek
    Signatur:
    BIO:AB:5000:MiE:425:2007
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Zentrale Hochschulbibliothek Lübeck
    Signatur:
    1508 AZ:425
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Osnabrück
    Signatur:
    VOF / Met 425
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Rostock
    Signatur:
    73 A 78a (425)
    Fernleihe:
    uneingeschränkte Fernleihe, Kopie und Ausleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)
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      BibTeX-Format
    Hinweise zum Inhalt
    Quelle: Verbundkataloge
    Beteiligt: Gott, Jonatha M.
    Sprache: Englisch
    Medientyp: Buch (Monographie)
    Format: Druck
    ISBN: 0123741556; 9780123741554
    RVK Klassifikation: VK 8700 ; WC 4355 ; WC 4460
    Schriftenreihe: Methods in enzymology ; 425
    Schlagworte: RNA editing
    Umfang: XLII, 433, [8] S., Ill., graph. Darst.
  4. RNA modification
    Autor*in:
    Erschienen: 2007
    Verlag:  Elsevier, Acad. Press, Amsterdam [u.a.]

    The presence of modified nucleotides in cellular RNAs has been known for decades and over 100 distinct RNA modifications have been characterized to date. While the exact role of many of these modifications is still unclear, many are highly conserved... mehr

    Standort:
    Universitätsbibliothek Braunschweig
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Niedersächsische Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt / Zentrale
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Staats- und Universitätsbibliothek Hamburg Carl von Ossietzky
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universität Potsdam, Universitätsbibliothek
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
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    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

    Standort:
    Universitätsbibliothek Rostock
    Fernleihe:
    keine Fernleihe
    Link zum Verbundkatalog:
    Gemeinsamer Bibliotheksverbund (GBV)

     

    The presence of modified nucleotides in cellular RNAs has been known for decades and over 100 distinct RNA modifications have been characterized to date. While the exact role of many of these modifications is still unclear, many are highly conserved across evolution and most contribute to the overall fitness of the organism. In recent years, new methods and bioinformatics approaches have been developed for the dissection of modification pathways and functions. These methods intersect a number of related fields, ranging from RNA processing to comparative genomics and systems biology. In addition, many of the techniques described in this volume have broad applicability, particularly in regards to the isolation, characterization, and reconstitution of ribonucleoprotein complexes, expanding the experimental repertoire available to all RNA researchers.

     
    Export in Literaturverwaltung   RIS-Format
      BibTeX-Format
    Hinweise zum Inhalt
    Quelle: Verbundkataloge
    Beteiligt: Gott, Jonatha M.
    Sprache: Englisch
    Medientyp: Ebook
    Format: Online
    ISBN: 0123741556; 9780123741554
    RVK Klassifikation: VK 8700 ; WC 4355
    Schriftenreihe: Methods in enzymology ; 425
    Schlagworte: RNA editing
    Umfang: Online-Ressource (XLII, 433, [8] S.)
    Bemerkung(en):

    Includes bibliographical references and indexes

    Cover; Contents; Contributors; Preface; Volumes in Series; Section I: Modified Nucleotides; Chapter 1: Identifying Modifications in RNA by MALDI Mass Spectrometry; 1. Introduction; 2. Experimental Strategy; 3. Experimental Procedures; 3.1. Isolation of RNA sequences; 3.2. Digestion of RNA to oligonucleotides; 3.3. MALDI mass spectrometry analysis; 3.4. Tandem mass spectrometry; 3.5. Comparison of MALDI and ESI techniques; 4. Perspectives and Conclusion; Acknowledgments; References; Chapter 2: Identification of Modified Residues in RNAs by Reverse Transcription-Based Methods; 1. Introduction

    2. Reverse Transcription (RT)-Based Methods for Detection of Modified Residues2.1. Reverse transcriptases used for RNA analysis; 2.2. General protocol for primer labeling and reverse transcription of RNA; 3. RNA Extraction from Various Cell Types; 3.1. Protocol for the extraction of total RNA from archaeal or eukaryal cells; 3.2. Protocol for the extraction of total RNA from yeast cells; 4. RNA Modifications Detectable After Specific Chemical Treatment; 4.1. Detection of inosine using glyoxal treatment followed by RNAse T1 hydrolysis; 4.2. Detection of pseudouridine (C) residues

    4.3. Protocol for the detection of pseudouridine residues in RNA using CMCT modification4.4. Complementary approaches for C detection; 4.5. Detection of 5-methylcytosine (m5C); 4.6. Detection of 7-methylguanine (m7G); 4.7. Detection of 20-O-methylated nucleotides using OH cleavage or 20-OH reactivity; 4.8. Protocol for detection of 2'-O-methylated residues in RNA using OH-cleavage; 4.9. Detection of 2'-O-methylated nucleotides by use of low dNTP concentrations; 4.10. Protocol for detection of 2'-O-methylated residues in RNA by use of low dNTP concentrations

    4.11. Other chemical modification methods specific for 20-O-methylations4.12. Detection of dihydrouridine (D) residues by alkaline hydrolysis; 5. RNA Modifications Leading to RT Pauses Without Preliminary Chemical Treatment; 6. Conclusion; References; Section II: tRNA Modifications; Chapter 3: Detection of Enzymatic Activity of Transfer RNA Modification Enzymes Using Radiolabeled tRNA Substrates; 1. Introduction; 2. Identification of Modified Nucleotides in tRNA; 3. Testing the Activity of RNA Modification Enzymes

    3.1. In vitro production of T7-runoff transcripts and nearest-neighbor analysis of modified nucleotides3.2. Experimental conditions for testing activity of tRNA modification enzymes in vitro; 3.3. Optimization of enzymatic reaction conditions; 4. Complete Digestion of RNA with Various Nucleases; 4.1. Use of RNase T2 to generate 3'-monophosphate nucleosides; 4.2. Homemade RNase mix; 4.3. Use nuclease P1 to generate 50-monophosphate nucleosides; 4.4. Use of venom phosphodiesterase VPD, eventually in combination with nuclease P1 to generate 5'-monophosphate nucleosides

    4.5. Use of piperidine to generate mixes of 20- and 30-monophosphate nucleosides

    Electronic reproduction; Available via World Wide Web